Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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PTPRNQ16849 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
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PTPRNQ16849 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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PTPRNQ16849 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRNQ16849 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRNQ16849 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRNQ16849 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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PTPRNQ16849 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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PTPRNQ16849 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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PTPRNQ16849 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRNQ16849 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRNQ16849 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRNQ16849 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRNQ16849 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRNQ16849 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRNQ16849 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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