Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN21Q16825 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.1 ms