Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMAD1Q15797 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.4 ms