Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC3Q15034 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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