Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
R3HDM1Q15032 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
R3HDM1Q15032 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms