Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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