Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NR1I3Q14994 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NR1I3Q14994 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NR1I3Q14994 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NR1I3Q14994 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1I3Q14994 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1I3Q14994 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1I3Q14994 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1I3Q14994 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1I3Q14994 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1I3Q14994 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1I3Q14994 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1I3Q14994 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1I3Q14994 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1I3Q14994 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.9 ms