Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCINQ13939 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCINQ13939 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCINQ13939 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCINQ13939 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCINQ13939 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCINQ13939 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCINQ13939 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCINQ13939 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCINQ13939 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCINQ13939 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CCINQ13939 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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CCINQ13939 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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CCINQ13939 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCINQ13939 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCINQ13939 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCINQ13939 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCINQ13939 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCINQ13939 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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CCINQ13939 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCINQ13939 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCINQ13939 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCINQ13939 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCINQ13939 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCINQ13939 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCINQ13939 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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CCINQ13939 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCINQ13939 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCINQ13939 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCINQ13939 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCINQ13939 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCINQ13939 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CCINQ13939 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CCINQ13939 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CCINQ13939 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCINQ13939 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCINQ13939 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCINQ13939 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCINQ13939 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCINQ13939 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCINQ13939 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCINQ13939 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCINQ13939 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCINQ13939 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCINQ13939 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCINQ13939 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CCINQ13939 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CCINQ13939 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCINQ13939 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCINQ13939 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCINQ13939 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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CCINQ13939 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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CCINQ13939 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCINQ13939 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCINQ13939 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCINQ13939 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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CCINQ13939 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCINQ13939 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCINQ13939 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCINQ13939 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCINQ13939 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCINQ13939 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCINQ13939 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCINQ13939 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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CCINQ13939 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCINQ13939 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CCINQ13939 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCINQ13939 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCINQ13939 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCINQ13939 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CCINQ13939 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCINQ13939 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCINQ13939 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCINQ13939 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CCINQ13939 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCINQ13939 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCINQ13939 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCINQ13939 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCINQ13939 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCINQ13939 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCINQ13939 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCINQ13939 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCINQ13939 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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CCINQ13939 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCINQ13939 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCINQ13939 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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