Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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CDH18Q13634 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDH18Q13634 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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