Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BFSP2Q13515 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BFSP2Q13515 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BFSP2Q13515 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BFSP2Q13515 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BFSP2Q13515 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BFSP2Q13515 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BFSP2Q13515 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BFSP2Q13515 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BFSP2Q13515 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BFSP2Q13515 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BFSP2Q13515 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BFSP2Q13515 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BFSP2Q13515 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BFSP2Q13515 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BFSP2Q13515 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BFSP2Q13515 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BFSP2Q13515 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BFSP2Q13515 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BFSP2Q13515 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BFSP2Q13515 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BFSP2Q13515 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BFSP2Q13515 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BFSP2Q13515 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BFSP2Q13515 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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