Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
MSLNQ13421 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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