Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SP140Q13342 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SP140Q13342 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SP140Q13342 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SP140Q13342 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SP140Q13342 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SP140Q13342 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SP140Q13342 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SP140Q13342 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SP140Q13342 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SP140Q13342 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SP140Q13342 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SP140Q13342 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SP140Q13342 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SP140Q13342 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SP140Q13342 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SP140Q13342 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SP140Q13342 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SP140Q13342 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
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SP140Q13342 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SP140Q13342 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SP140Q13342 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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SP140Q13342 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SP140Q13342 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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SP140Q13342 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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SP140Q13342 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
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SP140Q13342 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
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SP140Q13342 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SP140Q13342 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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SP140Q13342 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SP140Q13342 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SP140Q13342 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SP140Q13342 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SP140Q13342 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SP140Q13342 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SP140Q13342 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SP140Q13342 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SP140Q13342 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SP140Q13342 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SP140Q13342 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SP140Q13342 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SP140Q13342 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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