Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SLAMF1Q13291 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.18□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SLAMF1Q13291 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.2 ms