Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEMA3FQ13275 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.8 ms