Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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PPFIA1Q13136 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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PPFIA1Q13136 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PPFIA1Q13136 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PPFIA1Q13136 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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