Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
DUSP4Q13115 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
DUSP4Q13115 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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