Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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