| FLII | Q13045 | RNU6-1165P-201 | ENST00000410119 | 107 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | RNU2-40P-201 | ENST00000410833 | 196 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-537P-201 | ENST00000517277 | 103 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | SLC9C2-201 | ENST00000367714 | 4428 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | CEP162-201 | ENST00000257766 | 5063 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA2B-201 | ENST00000384583 | 137 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-679P-201 | ENST00000391003 | 106 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6ATAC42P-201 | ENST00000408637 | 95 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP89-201 | ENST00000410300 | 108 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA19.1-201 | ENST00000410656 | 129 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | RNU7-137P-201 | ENST00000516788 | 62 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
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| FLII | Q13045 | XIRP2-201 | ENST00000295237 | 5246 nt | TSL 2 BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
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| FLII | Q13045 | SCN7A-207 | ENST00000621965 | 7186 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | DYNC2H1-203 | ENST00000398093 | 12945 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-865P-201 | ENST00000364772 | 107 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.448-201 | ENST00000384185 | 108 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | MIR4694-201 | ENST00000578534 | 80 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | MIR4285-201 | ENST00000581001 | 85 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | SEPT14P17-201 | ENST00000617978 | 177 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | MIR377-201 | ENST00000362145 | 69 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA16.1-201 | ENST00000364597 | 132 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
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| FLII | Q13045 | ZNFX1-AS1_2.1-201 | ENST00000610973 | 93 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
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| FLII | Q13045 | C9orf84-205 | ENST00000394779 | 5060 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.10-201 | ENST00000362371 | 110 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | RNY3P2-201 | ENST00000362918 | 102 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.78-201 | ENST00000362970 | 110 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6ATAC2P-201 | ENST00000387943 | 126 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | HMGN2P38-201 | ENST00000423806 | 265 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | AC015712.3-201 | ENST00000559380 | 164 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | AC009093.3-203 | ENST00000565800 | 121 nt | TSL 2 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | AC133485.1-201 | ENST00000567176 | 124 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | MIR3124-201 | ENST00000582636 | 67 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | SYT14-201 | ENST00000367015 | 5094 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-949P-201 | ENST00000384040 | 107 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.544-201 | ENST00000384650 | 113 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | MIR577-201 | ENST00000385196 | 96 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-447P-201 | ENST00000410293 | 104 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1118P-201 | ENST00000410382 | 104 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
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| FLII | Q13045 | RNU6-355P-201 | ENST00000410427 | 104 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-791P-201 | ENST00000410467 | 104 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-705P-201 | ENST00000410601 | 104 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1100P-201 | ENST00000410691 | 104 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-860P-201 | ENST00000410860 | 104 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1217P-201 | ENST00000411276 | 104 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-785P-201 | ENST00000411324 | 104 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | MRPL35P3-201 | ENST00000421557 | 364 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.677-201 | ENST00000516401 | 85 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1018P-201 | ENST00000516577 | 106 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | U6.90-201 | ENST00000614007 | 104 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | U6.70-201 | ENST00000620287 | 104 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1099P-201 | ENST00000363533 | 107 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | MIR563-201 | ENST00000385080 | 79 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1321P-201 | ENST00000390905 | 107 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-904P-201 | ENST00000516206 | 101 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | MIR4524B-201 | ENST00000581569 | 115 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-832P-201 | ENST00000363319 | 107 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
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| FLII | Q13045 | AL591704.2-201 | ENST00000421658 | 181 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | AC108729.3-201 | ENST00000513484 | 108 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-109P-201 | ENST00000516364 | 107 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
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| FLII | Q13045 | AC096720.1-201 | ENST00000604441 | 183 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | MIR8081-201 | ENST00000611533 | 95 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | FAM13A-AS1_1.1-201 | ENST00000612555 | 119 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.98-201 | ENST00000363109 | 102 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA75.2-201 | ENST00000391138 | 150 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA75.3-201 | ENST00000391231 | 150 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | SUMO2P12-201 | ENST00000405924 | 140 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | AL353813.1-201 | ENST00000440700 | 253 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RPS29P28-201 | ENST00000446439 | 141 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU7-48P-201 | ENST00000458875 | 63 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | AC108210.2-201 | ENST00000503681 | 201 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-548P-201 | ENST00000517083 | 115 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | MIR30D-201 | ENST00000362283 | 70 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1313P-201 | ENST00000362622 | 102 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.168-201 | ENST00000363740 | 102 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1201P-201 | ENST00000384227 | 107 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | MT-TF-201 | ENST00000387314 | 71 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1307P-201 | ENST00000391012 | 103 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | 5S_rRNA.2-201 | ENST00000391293 | 112 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6ATAC41P-201 | ENST00000408600 | 126 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | MIR4419B-201 | ENST00000577260 | 68 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | AL442128.1-201 | ENST00000615151 | 90 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA80D-201 | ENST00000384488 | 135 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.601-201 | ENST00000410500 | 113 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.659-201 | ENST00000515994 | 113 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | uc_338.6-201 | ENST00000613544 | 171 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.818-201 | ENST00000618813 | 71 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | TDRD15-202 | ENST00000622654 | 5805 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| FLII | Q13045 | ZNF654-201 | ENST00000309495 | 4957 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD113.3-201 | ENST00000364630 | 78 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| FLII | Q13045 | SCARNA23-201 | ENST00000516060 | 130 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |