Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-1.81□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRDM2Q13029 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
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