Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
BPTFQ12830 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
BPTFQ12830 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-2.1□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-2.11□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-2.14□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
BPTFQ12830 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
BPTFQ12830 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.5 ms