Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMARCB1Q12824 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMARCB1Q12824 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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