Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms