Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PGGT1BP53609 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PGGT1BP53609 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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PGGT1BP53609 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
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PGGT1BP53609 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PGGT1BP53609 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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