Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXA3O43365 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXA3O43365 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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