Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn15Q9Z0S5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn15Q9Z0S5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms