Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Tuba8Q9JJZ2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Tuba8Q9JJZ2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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