Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Necap2Q9D1J1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms