Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms