Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNRQ92752 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNRQ92752 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNRQ92752 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRQ92752 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
TNRQ92752 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TNRQ92752 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRQ92752 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRQ92752 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRQ92752 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRQ92752 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRQ92752 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRQ92752 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRQ92752 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRQ92752 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRQ92752 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRQ92752 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRQ92752 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRQ92752 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRQ92752 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRQ92752 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRQ92752 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRQ92752 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRQ92752 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRQ92752 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRQ92752 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRQ92752 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRQ92752 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRQ92752 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms