Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOPBP1Q92547 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms