Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL2Q6F5E8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms