Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms