Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP28Q4G0W2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms