Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms