Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

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Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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