Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF2Q01130 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms