Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms