Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BACE1P56817 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BACE1P56817 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BACE1P56817 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BACE1P56817 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BACE1P56817 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BACE1P56817 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BACE1P56817 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BACE1P56817 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BACE1P56817 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BACE1P56817 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BACE1P56817 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms