Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aqp4P55088 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms