Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt2P50752 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms