Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NdnP25233 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NdnP25233 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NdnP25233 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NdnP25233 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NdnP25233 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NdnP25233 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NdnP25233 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NdnP25233 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NdnP25233 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NdnP25233 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NdnP25233 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NdnP25233 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NdnP25233 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NdnP25233 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NdnP25233 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NdnP25233 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
NdnP25233 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NdnP25233 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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NdnP25233 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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NdnP25233 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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NdnP25233 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NdnP25233 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NdnP25233 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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