Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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PdgfaP20033 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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PdgfaP20033 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms