Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB1P08034 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB1P08034 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB1P08034 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB1P08034 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms