Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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