Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms