Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
PITRM1Q5JRX3 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PITRM1Q5JRX3 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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