Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GEN1Q17RS7 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
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GEN1Q17RS7 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
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GEN1Q17RS7 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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GEN1Q17RS7 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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GEN1Q17RS7 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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GEN1Q17RS7 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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GEN1Q17RS7 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GEN1Q17RS7 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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