Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN21Q16825 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPN21Q16825 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN21Q16825 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN21Q16825 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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