Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

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Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-1.6□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.6□□□□□ -2.66
LAMA3Q16787 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.6□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
LAMA3Q16787 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
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