Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
TBR1Q16650 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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